El torneo nacional de fútbol se jugará en tres etapas y habrá una final para coronar al campeón

Primera etapa:
Se jugará en la modalidad de todos contra todos, con 22 fechas. El ganador de esta etapa clasificará a la final del torneo, a la Copa Sudamericana como Ecuador 1 y a la Copa Libertadores de América del próximo año.

El segundo de la primera etapa clasificará a la Copa Sudamericana como Ecuador 2; el tercero de la primera etapa clasificará a la Copa Sudamericana como Ecuador 3.

Segunda etapa:
Se jugará en la modalidad de todos contra todos, con 22 fechas. El ganador de esta etapa clasificará a la final del torneo, a la Copa Sudamericana del próximo año, como Ecuador 1, y a la Copa Libertadores del próximo año.

Tercera etapa:
La tercera etapa del torneo se jugará para definir los cuatro primeros lugares del torneo nacional. Se enfrentarán los ganadores de la primera y segunda etapa por la disputa del campeonato y subcampeonato.

Los dos clubes que en sumatoria de puntos de las dos etapas iniciales, accedan al tercer y cuarto lugar, se enfrentarán por el tercer cupo a la Copa Libertadores de América del próximo año.

Los otros dos cupos para la Copa Sudamericana del próximo año se disputarán en la primera etapa del Campeonato Nacional del 2012